Segundo orientações da Organização Mundial de Saúde (OMS), a prática do recolhimento e extermínio de animais apenas agrava a problemática da superpopulação, uma vez que ao remover os animais de pequeno porte das ruas há um aumento na oferta de alimento e espaço, propiciando ainda mais a procriação destes animais. A solução, então, está na conscientização da posse responsável dos animais de companhia, pois se existem animais nas ruas é porque proprietários não se responsabilizaram pelos seus animais de estimação, deixando que crias indesejadas ocorressem ou mesmo abandonaram seu animalzinho à própria sorte. Por isso, diferentemente da maioria dos municípios, São Carlos não sacrifica animais sadios. Criado em 1993, pela Lei Municipal n.º 10.841, o Canil tem por diretriz principal a proteção dos animais de companhia. Desde então, é feito o recolhimento apenas de animais atropelados, doentes, agressivos ou suspeitos de outros agravos. Estes animais são recuperados, castrados e encaminhados para doação. Atualmente, são mantidos em média, 200 cães e 150 gatos no prédio do Canil Municipal de São Carlos.